Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXM1Q08050 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms