Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms