Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SPTBN1Q01082 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms