Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2BQ00403 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms