Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SIM1P81133 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIM1P81133 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms