Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms