Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-24P63145 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms