Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ABCE1P61221 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms