Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBASH3AP57075 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms