Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2BFSP57053 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
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