Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2A2P52657 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms