Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRPC1P48995 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms