Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIK3CBP42338 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms