Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFSF9P41273 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms