Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGAEP38570 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms