Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA4P35212 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA4P35212 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GJA4P35212 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms