Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CMPK1P30085 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms