Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBL1P28749 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBL1P28749 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBL1P28749 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBL1P28749 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBL1P28749 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBL1P28749 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBL1P28749 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBL1P28749 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBL1P28749 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBL1P28749 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBL1P28749 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBL1P28749 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBL1P28749 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBL1P28749 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBL1P28749 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RBL1P28749 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBL1P28749 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBL1P28749 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBL1P28749 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBL1P28749 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBL1P28749 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RBL1P28749 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RBL1P28749 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBL1P28749 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBL1P28749 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBL1P28749 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBL1P28749 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBL1P28749 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBL1P28749 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBL1P28749 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBL1P28749 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBL1P28749 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBL1P28749 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBL1P28749 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBL1P28749 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBL1P28749 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBL1P28749 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBL1P28749 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBL1P28749 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBL1P28749 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBL1P28749 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBL1P28749 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBL1P28749 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBL1P28749 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBL1P28749 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBL1P28749 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBL1P28749 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBL1P28749 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBL1P28749 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBL1P28749 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBL1P28749 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBL1P28749 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBL1P28749 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBL1P28749 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RBL1P28749 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms