Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HLA-DMAP28067 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms