Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATF3P18847 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF3P18847 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF3P18847 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF3P18847 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF3P18847 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF3P18847 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF3P18847 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF3P18847 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF3P18847 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF3P18847 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF3P18847 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF3P18847 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF3P18847 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF3P18847 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF3P18847 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF3P18847 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF3P18847 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATF3P18847 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATF3P18847 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATF3P18847 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
ATF3P18847 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ATF3P18847 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATF3P18847 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATF3P18847 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATF3P18847 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATF3P18847 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATF3P18847 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATF3P18847 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATF3P18847 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATF3P18847 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATF3P18847 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATF3P18847 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATF3P18847 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATF3P18847 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATF3P18847 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATF3P18847 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATF3P18847 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATF3P18847 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATF3P18847 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATF3P18847 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATF3P18847 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATF3P18847 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATF3P18847 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATF3P18847 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATF3P18847 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATF3P18847 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATF3P18847 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATF3P18847 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATF3P18847 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATF3P18847 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATF3P18847 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATF3P18847 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATF3P18847 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATF3P18847 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATF3P18847 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATF3P18847 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATF3P18847 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATF3P18847 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATF3P18847 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATF3P18847 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATF3P18847 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATF3P18847 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATF3P18847 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATF3P18847 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATF3P18847 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATF3P18847 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATF3P18847 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATF3P18847 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATF3P18847 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms