Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRG2P13727 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRG2P13727 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRG2P13727 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRG2P13727 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRG2P13727 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRG2P13727 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRG2P13727 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRG2P13727 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRG2P13727 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRG2P13727 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRG2P13727 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRG2P13727 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRG2P13727 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRG2P13727 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRG2P13727 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRG2P13727 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRG2P13727 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRG2P13727 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRG2P13727 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRG2P13727 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRG2P13727 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms