Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TMEM225BP0DP42 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms