Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB1P08034 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB1P08034 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB1P08034 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB1P08034 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB1P08034 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB1P08034 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB1P08034 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB1P08034 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB1P08034 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB1P08034 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB1P08034 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB1P08034 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB1P08034 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB1P08034 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB1P08034 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB1P08034 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB1P08034 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB1P08034 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB1P08034 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB1P08034 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB1P08034 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB1P08034 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB1P08034 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB1P08034 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB1P08034 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB1P08034 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GJB1P08034 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GJB1P08034 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GJB1P08034 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GJB1P08034 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB1P08034 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB1P08034 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms