Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAPBO95292 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAPBO95292 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
VAPBO95292 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VAPBO95292 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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