Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRAMEF10O60809 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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PRAMEF10O60809 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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PRAMEF10O60809 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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PRAMEF10O60809 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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PRAMEF10O60809 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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PRAMEF10O60809 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF10O60809 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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