Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SPAG9O60271 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
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