Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CREB3O43889 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CREB3O43889 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB3O43889 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB3O43889 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB3O43889 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB3O43889 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB3O43889 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB3O43889 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB3O43889 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB3O43889 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB3O43889 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB3O43889 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB3O43889 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB3O43889 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB3O43889 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB3O43889 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB3O43889 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB3O43889 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB3O43889 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB3O43889 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB3O43889 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB3O43889 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB3O43889 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB3O43889 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB3O43889 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB3O43889 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB3O43889 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB3O43889 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CREB3O43889 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms