Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf172C9J069 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms