Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVV-2B6SEH9 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms