Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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C4orf47A7E2U8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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C4orf47A7E2U8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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C4orf47A7E2U8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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C4orf47A7E2U8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf47A7E2U8 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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