Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GMNCA6NCL1 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms