Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSDA5PKW4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms