Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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