Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms