Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms