Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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COPS7AQ9UBW8 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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COPS7AQ9UBW8 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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