Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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