Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DDIT4Q9NX09 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms