Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUE0

ZDHHC18, Palmitoyltransferase ZDHHC18, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC18Q9NUE0 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZDHHC18Q9NUE0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms