Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4BQ9NPR2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms