Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GOPCQ9HD26 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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