Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NRDE2Q9H7Z3 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NRDE2Q9H7Z3 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms