Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C20orf27Q9GZN8 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C20orf27Q9GZN8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms