Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NLRP1Q9C000 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms