Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
MAP1LC3CQ9BXW4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms