Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms