Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS5

TRMT61B, tRNA (adenine(58)-N(1))-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT61BQ9BVS5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRMT61BQ9BVS5 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms