Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms