Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms