Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms